Alvaro Mejia Flores, da Colômbia, foi o grande herói da São Silvestre de 1966. O atleta, que disputou a liderança da prova com o belga Gaston Roelants, se beneficiou com a contusão de seu principal adversário. O corredor da Bélgica sofreu uma distensão na perna esquerda e terminou o trajeto, mancando, na segunda colocação. O colombiano faturou o título com o tempo de 29min57s7. Naquele ano, a competição teve o seu percurso ampliado de 7,4 para 9,2 mil metros.

Flores deteve os recordes nacionais nos 5 mil metros (13min53s4) e nos 10 mil metros rasos com o tempo de 29min10s4.